根据目前的情况，4月份和6月份可以同时申请增量留抵退税。一般情况下，每个月企业只能申请一次，但是因为4月份和6月份有变动，所以可以同时申报。但是，一年最多只能申请两次增量留抵退税，不管发生更改的情况，每年最多只能申报两次。所以，如果企业在今年已经申请了2次增量留抵退税，那么就不能再申请了。 此外，企业在申请增量留抵退税时，需要提供税收申报表、计算书以及发票等资料，这些资料都会被税务部门查验，所以企业在申请增量留抵退税时，要注意申请过程中的资料准确性、完整性和真实性。