首先，小规模公司需要对客户把款项打到公司公户而没有开发票的情况进行处理。 具体的处理流程如下： 1. 公司应该将客户的付款信息和用户信息收集起来，结合双方的有关合同文件，建立内部统一计费模式。 2. 公司应当决定一个有效的发票号码并将其写入客户的账单记录中，同时记录客户的付款信息。 3. 公司可以选择手动开具发票，或者使用电子发票系统实现开票，保证发票准确无误。 4. 公司可以按月或按天判定发票维护费用和税额，由客户来负担。 5. 公司应该尽快发票给客户并保管起来，每年需要做好相关的凭证保管工作。 以上就是小规模公司处理客户把款项打到公司公户而没有开发票的流程，此外，公司还需要建立规范的财务管理制度，让财务人员明确公司的财务税收利润和客户付款等状况，从而使公司更好地遵守税收法律法规，并且有效规避错误。