农业企业可以开加工发票，但需要在加工过程中满足一定条件。一是，以农产品和农产品加工制品为原料，加工制作符合国家标准的农产品加工制品；二是，提供合格的检验报告（原产地检验报告或实验室报告），申明加工原料的农产品质量无争议；三是，加工的过程符合国家规定的标准，并且采用国家允许的加工方式加工；四是，每一批农产品加工制品必须建立现场加工记录，并留下抽检样品。 拓展知识：农业部门允许采用联合加工和联合贮藏模式，允许农产品中转贸易，允许合法经营加工山货和跨境农产品。现在的加工企业只要达到一定的食品安全标准，就可以正常生产加工发票。除了相应的条件，加工企业还要及时取得《食品安全管理认证》，定期抽检所加工的产品，以便检验产品的品质和质量，确保食品安全。