在这种情况下，处理公司欠总公司的账务就比较复杂了，因为分公司已经注销，可能就没有足够的资金来偿还欠总公司的账务了。 建议总公司可以以一定的时间段来撤销挂账，并将其记录在一个特定的文件中，便于查询和管理。同时，总公司也可以以一定的时间间隔发出催款函，但要注意税收问题。另外，也可以向分公司拿押金，以防在分公司注销前发生欠款问题。 总之，处理公司欠总公司的账务，应当从收回欠款、收取税收、开出催款函等多方面出发，找到一个平衡点，防止欠款超额增加，同时又能尽可能收回欠款。 另外，总公司应当充分利用合并报表，定期检查分公司的财务状况，及时发现风险，避免欠款不断累积。