A公司在开具相应的服务发票时，应把少回款的金额列入发票内，以待收回。当B公司开具水费发票给A公司时，A公司可以把水费发票和之前收回的少回款的发票抵扣。首先，将少回款的发票的内容更改为“收回少回款”，将水费发票内容更改为“以少回款发票抵扣”；其次，可以在记账时将未收回的少回款金额在收款方开立新的应收款项，水费发票金额在收款方开立以抵扣原少回款发票的其他应收款项账户，将两个账户金额一并记入一笔应收账款中；最后，用其他款项抵扣收款账款金额，抵消完毕后，则把账户余额全部清零，结算完毕。 拓展知识：少回款是指客户因自身原因造成的款项未回收现象，发生少回款的原因可能是：客户资金受限，客户账款被坏账抵消，一次性服务收费项目客户拒绝支付，客户拖欠账款，客户因其他原因不能支付等。