电子发票的存档方式一般以纸质版本为主，首先，纸质版本的电子发票应当采用安全的文件夹或文件箱密封保管，发票页面上的内容应当清晰可见；其次，纸质版本电子发票可以分类存档，比如，圆珠笔可以写上存档编号，一般以“年度-发票代码-发票号码”的方式来备案，便于后期快速查找；最后，此外，还可以将电子发票存储到电脑中，便于检索和管理，可以建立一个专门的电子发票存档管理系统，以更有效的管理和存档电子发票。 拓展知识：另外，采用云式的发票存档也是一种比较可行的方法，这种方法可以在发票受到损坏或者遗失的情况下，及时进行恢复。云式存档可以更加灵活、及时、安全地进行发票存档，而且发票存档的管理也可以更加精细化。