根据《中华人民共和国发票管理条例》第七条，购买货物、加工修理修配、服务、租赁或者财产所得应纳税的，发票领用方应当向销售方申请开具发票。 因此，我们苗木公司购入苗木自其他公司并销售给甲方，理论上苗木公司可以申请开免税发票。 但是，该免税发票只能有效减免苗木公司的消费税，因为我们的客户甲方的财产所得已在税收层面流转，本身已免税。 拓展知识：《中华人民共和国发票管理条例》是我国规定发票的法律规范，其中主要规定了关于发票的申领、开具、使用、登记、存档、保管及发票收入处理等若干有关事项，旨在规范发票管理活动，提高对发票收入和支出的政府管理和监督水平。