首先，收到留底退税分录应如下： 1. 银行科目：应收税款减少； 2. 应交税款科目：银行； 3. 增值税留底科目：应收税款增加； 4. 增值税留底科目：应交税款减少。 此外，进行留底退税的时候，应严格按照有关规定，来检查公司的未缴纳的税费，做到如实缴纳，以免产生税务风险。另外，根据企业收入情况，可以适当拆解税款缴纳，采取有效税收筹划措施，有效降低企业税负。