根据有关法律法规规定，对于新成立的公司，1000万元的注册资本，不管是实缴还是虚缴，都要支付税收。印花税是其中一种税种，从法律意义上讲，它不属于“实缴”和“虚缴”之分，而是一种被税收和财产交易相关的税收。新成立的公司，要支付印花税，除了支付注册资本外，还需要办理股份印花税手续，向税务机关支付股份印花税。印花税的支付不因实缴或虚缴的情况而有所不同，而是一次性的支付，要求新成立的公司完成印花税的支付，在法律上具有约束力。 另外，必须要说明的是，印花税不同于其他税收，它被称为直接性的税收，也就是说，它是一种无形的税收，缴纳者只需支付预计的税收即可。同时，印花税也是一种比较高的税收，比一般税收要高出0.5%至2%，因此新成立公司在支付印花税时应谨慎，要加强财务管理和审计工作，以避免高额的税收产生。