答：这种情况下，收入申报要按照400万标准确认，也就是说在收入金额上申报400万，补充发票也按400万标准开发，其增值税可在申报时进行抵扣，成本申报确认则要根据真实实际情况来进行确认，也就是要实际反映在工程中使用的资源，包括材料、人工等，记录在确认单内以及财务报表上，这样才能有助于确认工程真实发生的成本。 拓展知识：按工程确认单的确认金额应当是项目真实的费用，并且要同时遵守税收政策，保护各方权益，当甲方要求按照不实实情根据项目确认单申报增值税，双方可以协商，在考虑到各自利益均衡的情况下可以达成一致意见，确定最合理的申报税收金额。