在纳税申报表中，开具农产品自开免费收购发票的，应当在“收入减征项目”的“营改增专用发票收入减征情况”栏内，填写相应营改增专用发票；若发票未开出营改增专用发票，则将发票内容填写在“其它发票抵扣情况”栏内，需提供发票原件及相应注明核实，减掉不计税收入或抵扣税金。同时，企业在从购入原材料时，应当准确把握个人、非营利组织购买和使用农产品的收购不得征收营业税和消费税的规定及申报税款的时间节点，以免缴纳的税款不够抵扣的情况发生。此外，为了拓宽企业的经营空间，支持农民致富，可以通过积分抵扣等措施，让企业享有更多的政策福利。