环境咨询评价费5000元应该在企业账户上分账，按照《企业会计准则》的规定，应划归“研究、试验、开发支出”科目，分类记入支出类的科目，比如“研究开发费用”，“费用评价费”等，以确保有效财务报告披露。此外，企业还应建立环境咨询评价费的支付控制机制，做好发票、收据等会计凭证的备份工作，以便查档会计核算。 拓展知识：环境咨询评价费是指企业雇佣某个环保机构对其环境影响评估研究和资料收集等，由该环保机构发出的费用。主要服务内容包括环保影响评估、污染源清查及污染源排查、环境保护规划、污染源设计、污染控制技术等。