先给出答案：公司应按照员工实际发放的工资提成，但是，应该在提成中扣除每月因公司代缴的社保部分。 由于提成算法是按照销售额来计算的，因此，公司应按照员工实际发放的工资进行提成，而不是按应发工资进行提成。例如，如果员工本月应发1000元，但实际发放了500元，那么公司应该按照500元进行提成，而不是按1000元进行提成。 另外，公司应在计算提成时，扣除每月因公司代缴的社保部分。这是因为，公司的社保代缴是以扣除员工工资的形式完成的，而提成计算是以员工实际收入为基础来进行定义的，因此，应该把代缴的社保部分从提成中扣除。 总的来说，公司应按照员工实际发放的工资提成，但是，应该在提成中扣除每月因公司代缴的社保部分。 拓展知识：计算提成时，除了考虑工资发放和社保代缴双方的情况外，公司还应考虑员工实际获得的其他收入，如补贴、福利等，对这部分收入进行适当的减免或者扣除，以避免公司支付更高的提成费用。