农业公司自产的农作物作为原材料要进行入账，首先需要根据不同的农作物的原材料及成本，在会计科目上分别建立原材料科目，比如：水果原材料、面粉原材料等。然后要按照一定的标准进行主营业务收入及费用的报销，例如：应收账款、销售收入等，对原材料购买科目分类录入，确保所录入的信息准确性。最后，要进行生产成本的核算，将原材料、人工费用、管理费用等核算在一起，然后将农作物自产的成本进行统计，最后进行入账操作。 拓展知识：企业的生产成本的核算通常采用的是工厂成本，它将产品制造过程中的原材料、能源、人工工资、管理费用按照相应的工作量进行计算核算，以实现企业生产成本的控制，从而提高企业的效益。