分公司独立核算，增值税可以单独申报，企业所得税一般也可以单独申报。具体情况要结合实际情况考虑，如果分公司是一家完全独立的公司，并且没有分支机构，那么该分公司就可以单独申报企业所得税。但如果分公司是一家分支机构的话，即使它们拥有独立的核算，企业所得税也只能和总公司一起申报。另外，有的地方可能拥有不同的企业所得税政策，对于它们的企业会有不同的要求，分公司也可能需要单独申报企业所得税。 此外，企业所得税的申报和计算也比较复杂，分公司须有相应的财务人员来负责相关税收管理工作，进行财务核算和税务申报等，以防税务相关方面的漏洞。同时，分公司也应密切关注最新的税收政策和法律条文的变化，做到尽职尽责，遵守相关税收法律法规，以免出现违法情况。