运费增值税专用发票可以抵扣，抵扣原则是发票必须存在购买方和销售方的名称、税号、地址、电话等信息，开具发票时增值税税额也应该归入发票内容，发票必须经过专门的发票管理机构审核，并取得正式的发票代码。 在国家增值税专用发票的使用过程中，购买方可以抵扣该发票对应的税额，抵扣的标准是按照国家有关规定来进行计算，而不能按照商家或销售方的实际税额来计算抵扣额。 拓展知识：运费增值税专用发票可以在售后期内抵扣，但在售后期之后的半年内不可以再抵扣，这是因为普通发票的抵扣期限是半年，而增值税专用发票只有六个月的抵扣期限。因此，增值税专用发票的使用限期为半年。