个税系统带不出部分员工专项附加扣除信息，主要是由于该员工缺少必要的认可资格。首先，必须确保企业和员工都符合专项附加扣除认可标准。其次，该员工必须向国家的税务机关提交专项附加扣除的认可申请，申请得到认可后，才能使个人所得税免征或减税。最后，附加扣除的资料每年要更新，如果企业和员工缺乏及时的文件更新，也会导致个税系统无法带出部分员工的专项附加扣除信息。 此外，农民工和残疾人也属于可以享受专项附加扣除的特殊情况，但前提是获得相应认可，否则也无法享受到这种税收优惠。因此，当员工申请专项附加扣除时，要清楚的了解自己的特殊情况，并确认自己是否符合扣除的认可标准，以及是否提交了申请表等相关文件，以确保可以得到认可。