以公司的名义买车，是可以抵扣增值税的。根据国家有关规定，公司在购买购置设备、车辆时，可以抵扣增值税，但是必须有相应的发票凭证才可以申请抵扣。但是，如果公司买车两年之后，将车辆转入个人名下，仍然需要缴纳一定的税款。根据《个人所得税法》的规定，在转移个人资产的过程中，个人应缴纳资本利得税，资本利得税按不同计税对象，税率不同。例如，对于转移的车辆，税率为10%，即买车时付款的10%作为资本利得税。 此外，在转移车辆时，还需要缴纳车辆购置税，购置税的计算方式为所购买车辆当次总价（包括税金）X购置税率之和，其中，购置税率因地区而异，一般来说，大城市的购置税是比较高的。 拓展知识：此外， 在购买车辆过程中，应当注意登记证书的更改等手续，并完成车辆过户的手续，避免由此带来的不必要的麻烦。