小微企业年应纳所得税的计算方式取决于企业年应纳税额，如果企业年应纳税额在300万以下，一般采用预缴税款计算方式，即100万＊2.5%+超过100万部分＊10%的计算方式进行计算。企业按月预缴税款，每月应缴税款=当月实缴税款×未抵扣税额占年度应缴税款比例。当年度累计实缴税款等于年度应缴税款时，企业本年度的税款缴纳结束。 拓展知识： 如果小微企业的年应纳税额超过300万，则采取“定期预缴税和年终一次性结算”的税款计算方式，即按月定期预缴税款，年度应纳税额不低于年度实际收入所得额5%，年度预缴税款累计金额不低于应纳税款金额，年底需进行一次性结算，缴纳差额税款。