首先，在回答本问题之前，我们要先了解完整的EPC工程合同的内容，以及各个参与方的合同义务，权利等。另外，根据相关法规，合同中所规定的发票开具程序也要遵循。 从这个问题可以看出，A公司发票开给B公司，B公司再将发票开给我们公司，而我们公司领导想把款直接付给A公司。这种情况可能是EPC工程合同中未规定的，所以需要先行经A公司和B公司的双方协商同意，完成发票开给我们公司的过程，再审查合同内容，确认权利和义务，最后根据我们公司与A公司和B公司之间的合同约定，合理支付款项。 另外，在支付款项的过程中，我们公司应加强严格的财务审查，确保支付合法合规，以避免在付款方面发生不良后果。