进口农产品的进项税可以通过抵扣的方式进行，在获取完税凭证后，可以根据完税凭证中抵扣的情况，勾选抵扣，完成后就可以做进项税了。需要注意的是，有的完税凭证中的抵扣只可以以抵扣的形式准予扣除，不可以使用现金抵税的方式，因此需要了解政策的要求，提前做好准备，以免造成不必要的影响。此外，值得注意的是，在核销抵扣进项税时，企业需要遵守有关税务登记、发票管理、核销管理等法律法规，确保税务管理的有序和规范。 拓展知识：进口农产品完税凭证勾选抵扣可以减免支付的增值税是按照我国税法有关规定进行的，因此，企业在有关完税凭证中应尽量准确地勾选抵扣，及时地进行增值税实时认定，以降低自己的税负损失，同时也可以减少财政收入缺口。