B公司可以通过银行汇款或网上转账给A公司，也可以通过支票对A公司进行支付，但是A公司收款时无法开具发票。B公司可以通过与A公司签订服务协议，在协议中规定通过支付宝、微信支付或银行汇款给A公司支付款项，收款后A公司提供详细的发票并进行开票，B公司也可以在发票上面填上自己的公司名称和税号，以获得对应的增值税发票。 除了上述方式以外，A公司也可以将款项转到一个第三方账户，该第三方账户账号属于私人账户，B公司可以先将费用支付到这个第三方的账户，然后A公司可以在第三方账户中提取这些款项，这种方式也可以获得发票，但也存在一定风险，A公司要对此进行谨慎对待。