小规模药店在开具发票和缴纳税款方面还是应当按照3%进行缴纳的，但是要注意的是有的药品按照不同的税率征收，比如抗生素和西药类产品，其税率并不在3%范围内，这时候我们就需要根据实际情况来调整税率。另外，小规模药店纳税也要根据其月度实际销售额来决定，比如，小规模药店在某月销售额不超过50万，则需要按照3%纳税；如果超过50万，则相应的纳税率也会有所调整，要更高一些。 拓展知识：近年来，税务总局采取新的促税政策，为小规模纳税者减轻税收负担，并扩大税收优惠政策的范围。小规模纳税人在发生某些特定类型的业务时，可享受减按一定比例的税率和免征限定的税收政策，减轻税负。因此，小规模药店在缴纳税款方面，一定要根据自己的实际情况，熟悉有关政策法规，科学合理申报税款，减轻自身税收负担。