根据分公司多付货款的实际情况，总公司是否可以退回货款，需要根据约定的财务规定和合同约定来判断。如果分公司的货款在总公司的财务规定中，存在有独立核算的收支记账条件，那么总公司是可以将已经多支付的货款退回给分公司的。如果在总公司的财务规定中没有关于独立核算的对应收支记账条件，那么在总公司进行多支付货款的退还时，需要有完整的单据材料作为依据，这样才能确保财务支出正确记账，以及便于总公司运用支出材料进行财务审计。 拓展知识：独立核算是企业或组织内部财务管理中，为某项特殊收支而采取的独立记账、划分识别的管理方法，其主要目的是为了更加精准的地记账，使收支可控，减少浪费。