免税发票和普通发票在税控盘里是分别填开的，免税发票是一种特殊的票据，主要是指在农产品购买、销售场合，买方可以免征增值税的发票，其具有可抵扣增值税的特点。免税发票在目前主要是以普通机打发票格式出现，其上面会有特殊注明“农产品免税发票”的字样，这样才能够抵扣税点。这种发票往往会有一个专门的税控码，以及一个标准的税收分类编码，以便进行增值税结算。拓展知识： 在普通发票领域，有各种不同的发票，比如：增值税普通发票和专用发票；在农产品发票领域，有农产品专用发票，农产品普通发票，以及农产品免税发票，这些发票都有其特定的用途，应根据交易实际情况选择正确的发票。