查询发票对方已抵扣时，首先需要进行登录税务网，打开发票查询系统，输入自己的纳税人识别号和查询发票的号码以及其他信息，如发票代码、发票类型等，然后就可以检索该发票的信息，查看对方是否已经抵扣该发票了。拓展知识：现在普遍采用电子智能发票，电子智能发票拥有智能识别二维码、维护完整发票数据、税务信息一体化等一系列功能。电子智能发票方便了企业与税务部门之间的互动，并且也带来了更加便捷的纳税管理。