企业在申请制造留抵退税时，一般有两种方式：存量留抵退税和增量留抵退税。存量留抵退税是指企业在投产前就申请抵扣，增量留抵退税则是指企业在投产后再次申请抵扣。 对于企业来说，选择存量有优势也有劣势，优势是可以节约大量时间，但是在存量留抵退税申请的过程中，企业需要申报自身的主要制造资产，中央政府的重点监管，审核速度会比较慢的。增量留抵抵税，因为本身的重点监管小，审核速度要快得多。但是，企业需要不断地申报和审核，这就为企业带来了更多的工作量，时间成本也比较大。 因此，企业在选择留抵退税申请时，应根据自身实际情况，选择最适合自己的申请方式。 拓展知识：企业申请留抵退税，还可以选择服务性企业留抵退税，这种申请方式就是通过合同将购买服务和抵扣税款结合在一起，来获得税收优惠的方式。