小规模纳税人如果只开出负数发票的话，建议可以先在财务软件中将其进行汇总合计，取正数，然后填入税收申报中，这样税务机关也可以正常登录申报。另外，小规模纳税人在申报过程中，除了填写发票信息外，还需要准备相关财务凭证以证明费用的真实性，如收入明细、费用清单、收支凭证等，以及来源证明和确认书等。另外，为了保证申报的准确性，可以按财政部门规定的标准准备申报所需的财务资料，这样可以让税务机关及时拿出统计数据，进行审核。 同时，小规模纳税人申报过程中，可以借助电商企业认证服务提供商的一站式认证服务，节约申报时间，精算税收，还可以可以获得会计财税咨询和拓展业务咨询服务，提高申报准确度和及时性，可以有效减少小规模纳税人的负担。