水利建设基金的计税基础是指符合条件的建设基金，凡发放的基金应当缴纳个税。根据《中华人民共和国个人所得税法》的规定，财政部和国家税务总局联合颁布的《关于个人所得税税前扣除水利建设基金等扣除额度调整有关问题的通知》，明确发放基金应当缴纳个人所得税，具体如下： 一、基金来源及计税基础： 1、从下列处发放的基金，应当按规定缴纳个人所得税： （1）水利建设基金； （2）社会保险基金； （3）居民家庭减免费用； （4）国家安全基金； （5）国家安康基金； （6）中央和地方投入的公益支出； （7）社会救济支出； （8）国家聚垄股份上市基金； （9）地方政府扶持政策性资金等。 2、发放的基金应计入个税计税基数，按照个税征收率及个税扣除标准扣除前计算应纳税所得额，按照月额实行企业代扣代缴。 拓展知识：水利建设基金扣除标准，2018年每月个税扣除限额1000元，年度累计限额12000元，2019年每月个税扣除限额1500元，年度累计限额18000元，以此类推。