在这种情况下，最好的处理方式是，公司应该先拿出相关的财务记录，遵从有关法律法规，按照国家有关机构的要求提供，以说明该员工的个人信息的真实性。但是，公司有可能会因为这种情况而受到税务机关的处罚，如果有违法行为，则可能会受到处罚或者没收违法所得。此外，公司还要注意在今后的税务申报中，准确报告和申报个人和企业的税务状况，以确保正当纳税，拒绝逃税行为。最后，建议公司还要注意拓展企业的税收知识，以便今后的税收申报能够畅通有序。