对于作废的增值税普通发票第二联不见了的问题，应该采取以下措施： 一、如果发票第二联不见了，可及时向开票单位索取复印件，这样就可以正常使用发票； 二、如果发票第二联不见了，也可以向当地税务机关申请补开发票，申请补开发票需要提供申请补换发票的申请书、发票的原件、作废的发票的第一联复印件等； 三、如果发票第二联不见了，也可以向当地税务机关报损，报损需要提供发票的原件并根据税务机关的要求提供申报损益发票表格； 四、如果发票第二联不见了，也可以向当地税务机关提交申请折损税款的请求，申请折损税款需要提供请求书并根据税务机关的要求提供完整的折损税款申请表，并将发票的原件一并交回税务机关。 拓展知识：发票由税务机关发行，每张发票都是有价证券，一旦缺失或者作废，就无法申请开具发票。所以，发票作废时，要慎重对待，以免造成不必要的损失。