补缴个人所得税的操作一般如下： 1. 汇缴个人所得税，一般情况下，可以网上办理或者通过税务机关办理; 2. 办理税务机关核定的延期申请; 3. 通过税务机关申请抵税; 4. 补缴税款后，申请免收或减免罚金。 目前的政策规定，非居民个人缴纳顶长期滞纳的个人所得税，自缴纳之日起，可以申请减免罚款，减免比例一般为50%，最高可以减免至不滞纳罚款金额，但减免后金额不得低于人民币500元。 拓展知识： 未尽缴清税款的，可以通过两种方式补缴：一是向税务机关缴清所欠税款，另一种是在税务机关登记并安排拖欠税款的月度金额按期缴纳，但未办理税务登记的，不能进行按期缴纳。