个体工商户开具的发票金额超过6万元，应缴纳增值税。按照《中华人民共和国增值税暂行条例》规定，增值税实行累进税率体系。累进税率体系认定营业收入超过6万元的个体工商户按照金额为计算税率：营业收入6万元以下的，税率3%；营业收入6－20万元的，税率10%；营业收入20－50万元的，税率20%；营业收入50万元以上的，税率30%。 根据提到的个体工商户开具的发票金额超过6万元，这笔发票的金额为60万元，那么其应缴纳的增值税应该是：首先营业收入6万元以下部分，税率3%，即18000元；营业收入6－20万元部分，税率10%，即140000元；营业收入20－50万元部分，税率20%，即200000元；营业收入50万元以上部分，税率30%，即90000元，综上所述，个体工商户开具发票金额为60万元的应缴纳的增值税，其具体金额为18000元+140000元+200000元+90000元=348000元。 拓展：增值税是一种按照营业收入计算和征收的税种，是一种按照市场价格计算的税，是一种与社会生产活动直接挂钩的税种。它是基于商品生产和流通的经济行为而产生的税种，它侧重于货物、服务生产过程中劳务、利润等价值增加税，是以差额税的形式实行的消费税。