股东把股权转让给他的另外一个公司，个人所得税的计算方法如下： 1. 计算股权转让的价款：即计算转让的股权的价值，以及转让的实际价款。 2. 计算应纳税所得额：计算转让价款减去转让前股权的估值，即为该转让的税前所得； 3. 计算税负：税前所得根据当时的税收政策，按照现行税率计算应纳税额； 4. 计算实际纳税额：根据个人所得税法等征税规定，此外还可以根据抵扣扣税政策，减免部分税款，从而计算出实际纳税额。 拓展知识：股权转让的个税不同于股票的交易税，股权转让的个税主要是根据转让后的所得来计算。计税时，可以根据所得额来采取抵扣政策，减免一定比例的个税，从而获得个人税收优惠。