股份合作制的注销流程包括： 1、申请发起方提出注销申请，向董事会或相关行政机关提出注销申请； 2、向全体股东发出通知，股东和重大股东会议投票表决是否同意注销，同意率超过全体股东持股比例的75%； 3、依据会议投票结果，董事会或相关行政机关组织审议，确定是否批准注销； 4、征求工商局的意见后，出具注销决定，报经司法机关核实； 5、司法机关确定注销决定符合法律规定后，发出注销宣告； 6、按照股份合作制的注销程序办理注销手续，宣告公告； 7、经过清算结束，在工商登记机关申报办理注销登记。 股份合作制是经济运行中一种常见的法律形式，注销程序具有较为严格的程序性要求，股东应当严格按照法律规定的流程办理，以确保终止经营的正常流程和合法程序。