自然人电子税务局可以查出公司员工两处申报个税的记录，通常由税务机关负责收集和管理纳税证明、个人所得税纳税申报表等，以及综合评估和查验个人所得税情况。而自然人电子税务局则是由多个税务机关组建，构建了一套全国统一的自然人电子税务系统，是用户可以在全国范围内进行申报，查询，缴纳的国家信息共享平台，也提供个人申报查询功能，可以让用户及时准确地获取个人纳税信息。自然人电子税务局可用来查询公司员工两处申报个税的记录，可以做到税务系统信息与税务机关实际业务模式的相互融合，使用户能够获得更全面，更方便的服务。 拓展知识：自然人电子税务局把纳税申报系统与税务机关实际业务模式实现了紧密结合，帮助企业减轻管理压力，节约申报成本，并增强企业的可操作性。同时也为税务机关提供了一个可以实时监控、及时管理纳税人信息的信息反馈平台，这不仅可以有效提高税务机关的管理效率，也有助于加强政府部门对企业信息规范的管理。