首先，根据我国《企业所得税法》第十六条规定，企业出租房屋所产生的收入应纳入税前收入，并按照当地相关税务部门规定的税率计算企业所得税。根据不同地区的不同税率，企业出租房屋所产生的50万元收入，应缴纳的税费，将是5万元左右的企业所得税，具体数额，需根据地方税务部门的规定来计算。 此外，还需要按照国家规定，代开发票时，需要缴纳增值税，具体增值税税率也根据国家规定来定，一般是3%到17%之间。针对50万元收入，则应缴纳5万元左右的增值税。 总之，针对我们医院的租金一年50万，我们自己去代开发票，需要交多少税费,依据地方税务部门的规定和国家规定，总的税费约为10万元左右。 拓展知识：《企业所得税法》第十五条规定，尽管企业出租房屋所产生的收入适用企业所得税，但根据不同地区的规定，小规模纳税人将可以享受减免税政策，以减轻企业的税费负担。