入库的数量是正数，但总金额是负数，证明了有库存进入了管理系统，而金额却出现了负值，这是因为该货物的成本价格低于管理系统中记录的参考价格所致。此时，应该根据实际情况，调整系统中存储的参考价格，以符合实际情况，从而达到金额为正的目的。 在调整过程中，应考虑现有的参考价格与实际成本的大小关系，如果成本价格高于参考价格，那么此时调整系统中存储的参考价格应低于当前值以适应实际成本；如果成本价格低于参考价格，那么此时调整系统中存储的参考价格应高于当前值以适应实际成本。 此外，应考虑参考价格调整对期后商品流转价格的影响，以及对内部控制的影响，以保持系统的准确性并确保组织的正常运营。同时，要结合货物的特性，进行价格比较，确保价格的公正性。