如果有员工没有申报个税，则公司可能需要为未缴纳个税部分缴纳代扣代缴税款，企业所得税预缴时也可以按实际发工资人数的总金额扣除，因为公司可在下个月补缴被遗漏的税款。但是需要注意的是，如果公司未能及时补缴，应当承担滞纳金等税收制度上的处罚。 拓展知识：为了保障企业和员工的合法权益，企业应按规定定期报送员工的个人所得税申报表，及时缴纳个人所得税，妥善处理税款问题，尽量避免滞纳金及其他处罚措施的发生。