根据财务规定，我们在开具发票和结算工程款时，必须按照实际支付的金额填写发票，但是质保金必须分开记账和发票。根据您的需求，首先开出一张发票，金额为20000元，其中，记账上可以以20000-1000=19000的记账金额进行登记，同时在质保金的备注栏里，可以填写质保金1000元，然后再开一张发票，金额为1000元，记账为1000元，以此记账，即可解决您的问题。 拓展知识：质保金也叫工程保证金，是指在施工合同中，甲方将一定数量的资金存入一定的金融机构，以担保乙方履行施工合同的一种手段。质保金一般用于担保乙方按期完成施工，负责修理、补充、穿补及其他支付等事宜，是工程款支付的一种补充担保措施。