国税局疑点提醒中营业收入小于增值税申报表销售额的原因包括但不限于： 1、增值税申报表销售额中包含收取的被动收入，如押金或其他可以持续收取的费用； 2、增值税申报表销售额中包含折扣的额度，而营业收入则没有折扣的额度； 3、缺乏准确及完善的内部财务控制机制，使企业帐务在客户支付时没有及时更新账目； 4、帐务出现重新调整，比如商业折扣，成本折扣，结算处理等； 5、出现账务分割结算，在财务政策上可能改变原有纳税义务，导致两边税费收入出现差异； 一般情况下，企业应当加强内部财务控制机制的建立和完善，切实把握帐务的完备性及真实性，仔细核对销售额和营业收入的相符情况，以确保出现营业收入小于增值税申报表销售额的情况，避免受到税务监管机关的处罚。 此外，税收法律法规的改变也能影响营业收入小于增值税申报表销售额的情况，比如增值税改革，进口增值税临时减免政策，进出口税收政策等等，都会影响营业收入小于增值税申报表销售额的出现。