处理员工补办工卡转公司帐户需要做以下几个步骤： 1、员工补办工卡后需要把工资用工卡入账； 2、工资入账完毕后，将银行卡内的剩余金额（工资扣除后的余额），经过财务人员把金额转入公司帐户； 3、财务部把银行卡转入的金额，录入到公司账务软件中，并做出相应的会计分录，形成此次入账的账簿； 4、银行确认收入明细后，财务部就进行财务审核，核销记账，并做出报告，报告中包括：账户余额变更、交易信息及流水号等； 5、财务部及企业财务分管领导审核通过后，此次转帐即完成。 拓展：完成员工补办工卡转入公司帐户后，财务部还需要完成其他相关工作，如保护资金安全、提高财务精确度等，确保企业财务管理的有效性和可持续性发展。