根据税务部门的规定，企业购买原材料并发生拍卖佣金的情况，这部分拍卖佣金可以税前扣除。扣除的方式可以以原材料的购买费用为基准，将拍卖佣金作为一部分进行扣除，但该部分扣除金额不得超过5%，否则超出部分不能税前扣除。同时，该部分拍卖佣金所得需要经过相应的税收管理中心审批才能进行税前扣除，具体扣除金额需要按照其规定来实施。拓展知识：税收管理部门根据税法对拍卖市场所得的拍卖佣金进行税收征管，其中税前扣除企业所得税的部分不得超过5%。