小规模纳税人开具的专用发票比例有两种，一种是1%，另一种是3%。1%比率的发票是指小规模纳税人对于其销售的货物、提供的劳务，可以按照1%的比率开具专用发票，而3%比率的发票指的是小规模纳税人在开具发票时，除合法销售的货物收取货款之外，还补充收取费用，如手续费、安装费等费用，可以按照3%的比率开具发票。 在确定小规模纳税人开具专用发票的比率时，应根据实际经营情况把握，正确使用，以合法合规的方式，准确发票。最终，要保证企业在发票开具等方面的合规性，从而保证企业正确、有效缴纳税款。 此外，小规模纳税人还要注意把握专用发票当期开具额度的合理性，尽量避免额度过大导致发票漏开的情况出现，以免影响企业财务审计的真实性。