首先，可以设置一个科目来标记工程款，这个科目下的所有收入都应该标记为工程款。其次，当工程款入账时，可以在基本户中建立一个科目来记录工程款，并在一般户记录转账流出记录。最后，当基本户的工程款转移到一般户时，可以在一般户中建立一个科目来记录这些工程款，以此来区分此户的收入来源。此外，可以在支付管理软件中建立一条支付流程，从而可以查看每一笔支出的记录，并给出报表来追踪所有的收入和支出。