使用银行存款偿还到期的短期借款本金五万元，利息3000元已计提，首先要将五万借款本金汇入银行，并根据实际银行要求给出各种相应的证明文件和发票等。之后，在借款本金汇到银行以后，借款人需要根据银行规定进行到期支付利息，利息可以从银行账户中取出，也可以在开具发票的同时一起支付，且经过计提的3000元也可以在内。最后，此项借款会有相应的期限，等到期限到达时，该借款需要一次性归还，余下的本金可以从银行账户中取出。 除了通过银行存款的方式来偿还到期的短期借款，还可以综合使用信用贷款、票据贴现融资、保证贷款等方式，以满足不同企业实际融资需求。