首先，在发现重复的发票的情况下，需要核实原因，看是否系统出现问题，还是发票真的重复入账。如果是系统出现问题，需要及时修正；如果发票真的重复入账，需要检查重复发票的原因并根据实际情况作出处理（如回退已入账的费用或者冲正已入账的费用）。 除此之外，内控还应该加强对员工和部门发票使用、入账情况的监管学习，搞清入账发票的审核规则，并将规则落实到现行实践中，以减少发票入账的出现异常。另外，在入账发票时，还应该加强运作的记录完整性、账务准确性，减少发票相关的差错现象。 从根本上解决重复发票的出现，实施企业内部控制，建立健全企业财务管理制度，及时将金额大的发票等事务报送财务部门审批，实施财务科目的审核制度实施财务监督制度，并及时完成上级下达的报表，加强内控，防止类似重复发票入账的问题发生。