企业内部往来款只需要做一笔分录是可以的，但不一定只有这一种方式，可以根据实际情况采用不同的方式进行分录。如果是直接借贷，可以做一笔分录，借方为账户A，贷方为账户B；但也可以采用银行存入资金（贷），内部调拨（借），并扣减相应的应收账款（贷），内部调拨（借）的方式。另外，在进行往来款分录时，应该引入发票、支票等凭证，以便更好地体现企业内部往来款的处理和记录。此外，有时也可以增加银行手续费等分录，以体现企业真实的内部资金流动情况。