小规模个体户开专用发票时，应缴纳税款的税率为3%。这是由《中华人民共和国税收法》第十四条“小规模纳税人按照本法第九条规定缴纳税款的，实行简易手续缴纳税款，税率为3％。”所规定的。在此期间，小规模个体户开具发票的税率仍然为3%。除了开专票的税率是3%外，小规模个体户在缴纳其他税收时也应该按照3％的税率进行缴纳。 拓展知识：小规模纳税人是指按照中国税法确定的标准，累计销售额不超过500万元，年度专项扣除后应纳税额不超过50万元的纳税人。小规模纳税人按照本法第九条规定，可以享受税率折扣等优惠政策。