小规模的民间非营利组织属于非税务登记的组织，根据《发票管理条例》的规定，小规模的民间非营利组织需要参加开票信息服务，才能实行发票管理，从而对其免征增值税。此外，根据《增值税暂行条例》，小规模纳税人可以申请免征增值税，但其不得开具发票。因此，小规模的民间非营利组织不能开免税发票的。但是，小规模的民间非营利组织可以向已经办理税务登记证的组织或者个人申请对方代开发票，以减轻自身的税收负担，但是经代开发票方抵扣申请方税款纳税收入不能超出其年度累计销售额的四倍。拓展知识：除了小规模纳税人，一般纳税人也可以申请免征增值税，但是需要满足一定的条件，具体为：其一，属于享受增值税减免政策或增值税低税率征收项目的纳税人；其二，累计营业收入12个月内不超过50万元；其三，从业人员不超过20人。